W Super Mario 3D Land, podobnie jak w pierwszej odsłonie Super Mario Bros., istnieje tutaj limit czasowy na planszę, oraz kończą się one masztem z flagą, na który trzeba skoczyć przed upływem czasu, by ukończyć poziom.
Gra oferuje kilka tradycyjnych dopałek jak Super Mushroom (w tekście będą stosowane angielskie nazwy power-upów), Fire Flower, Starman, jak i kilka nowości. Najważniejszą z nich jest Tanooki Suit, zdobywany poprzez wzięcie Super Leaf. Jest to tradycyjny kostium z Super Mario Bros. 3, jednak dopiero w Super Mario 3D Land, ta dopałka wróciła do serii. Jest to najczęściej używany power-up, obecny jest nawet na okładce gry. Umożliwia szybowanie w powietrzu (spowolniony spadek), jak i atak ogonem. W późniejszych etapach gry dochodzi możliwość zamiany w statuę, która czyni nas chwilowo nietykalnymi.