Członkostwo oraz struktura organizacyjna Członkami Stowarzyszenia mogą być tylko sędziowie polskich sądów powszechnych, administracyjnych, wojskowych i Sądu Najwyższego, w tym sędziowie w stanie spoczynku. Sędzia składając podpisaną deklarację członkowską automatycznie zostaje członkiem stowarzyszenia bez jakiejkolwiek procedury przyjmowania. Odejście ze służby bez względu na jego przyczynę oznacza utratę członkostwa.
Władze: zebranie delegatów odbywające się nie rzadziej niż raz w roku. zarząd wybierany przez zebranie delegatów na 3-letnią kadencję (7-10 członków), komisja rewizyjna (3-osobowa)
Poza oddziałami w „Iustitii” funkcjonuje osiem zespołów programowych (tematycznych): informacyjny, prawa cywilnego, prawa karnego, międzynarodowy, monitorowania postępowań immunitetowych i dyscyplinarnych, szkoleniowy, statutowy oraz organizacji sądownictwa.
Prezesi Sędzia SN Maria Teresa Romer (lipiec 1990 – czerwiec 2008) Sędzia NSA Irena Kamińska (październik 2008 – listopad 2009) Sędzia SSO w Szczecinie Maciej Strączyński (luty 2010 – kwiecień 2016) Krystian Markiewicz (2016–2025) Bartłomiej Przymusiński (od 2025)