Działalność w latach 2015–2023 Obrona niezależności sądów i niezawisłości sędziowskiej oraz reprezentowanie interesów środowiska sędziowskiego należą do statutowych celów Stowarzyszenia. W latach 2015–2023, w związku z reformami wymiaru sprawiedliwości, działania w zakresie obrony niezależności sądownictwa stały się głównym nurtem działalności organizacji.
W grudniu 2015 w związku ze zmianami w Trybunale Konstytucyjnym, które zapoczątkowały wielomiesięczny kryzys wokół Trybunału, Stowarzyszenie wydało uchwałę wyrażającą sprzeciw wobec poselskiego projektu ustawy z 16.12.2015 o zmianie ustawy o Trybunale Konstytucyjnym. Zdaniem Iustitii ustawa prowadziła do paraliżu Trybunału, i co za tym idzie naruszenia art. 10 Konstytucji Rzeczypospolitej Polskiej, zgodnie z którym ustrój Rzeczypospolitej Polskiej opiera się na podziale i równowadze władz. Jednocześnie Stowarzyszenie zaapelowało do Prezydenta RP Andrzeja Dudy o powstrzymanie się od przyjęcia ślubowania od osób wybranych przez Sejm 2 grudnia 2015 na stanowiska sędziów Trybunału Konstytucyjnego do czasu rozstrzygnięcia przez Trybunał skarg dotyczących zgodności z Konstytucją RP wspomnianej wyżej ustawy.