W finale gry Kate odnajduje Hansa w Aralbadzie. Mężczyzna, niewzruszony wiadomością o śmierci siostry, bez wahania podpisuje przygotowane dokumenty. Tuż przed odlotem do Stanów Zjednoczonych Kate zmienia jednak decyzję, porzuca pracę i niewiernego narzeczonego, po czym dołącza do Hansa w podróży pociągiem, by pomóc mu spełnić marzenie o dotarciu na Syberię.
Rozgrywka Syberia jest komputerową grą przygodową typu „wskaż i kliknij”, prowadzoną z perspektywy trzeciej osoby. Sterowanie odbywa się wyłącznie za pomocą myszy – pojedyncze kliknięcie każe bohaterce iść w danym kierunku, podwójne wywołuje bieg, a kursor zmienia kształt w zależności od kontekstu, sygnalizując możliwość obejrzenia przedmiotu, jego użycia, podniesienia lub nawiązania rozmowy z postacią niezależną. Rdzeń rozgrywki stanowi rozwiązywanie zagadek logicznych, opartych głównie na przedmiotach zbieranych do ekwipunku oraz na obsłudze mechanizmów i automatów, a także prowadzenie dialogów, w których gracz wybiera tematy rozmów z notatnika bohaterki.