Ataki te osiągają większą liczbę zadawanych obrażeń i nie mogą chybić, lecz w przeciwieństwie do ataków standardowych, nigdy nie zadadzą obrażeń krytycznych, ani liczby większej niż jeden atak na turę. Udostępniona została funkcja walki automatycznej w celu przyspieszenia prostych starć.
Postacie przyłączone do drużyny, które nie biorą bezpośrednio udziału w walkach, oferują dodatkowe usługi, jak np. prowadzenie sklepu, udzielanie podpowiedzi odnośnie do poszukiwań nowych rekrutów, czy też pomoc w walkach strategicznych. Niektóre postacie trzymane w rezerwie na czas walki wyleczą drużynę po jej zakończeniu lub też dadzą większą szansę znalezienia rzadkich przedmiotów po walce.
Runy, źródło magii w świecie Suikoden, są wykorzystywane podobnie jak w poprzednich częściach serii. Liczba czarów możliwych do wykorzystania w czasie walki zależy od indywidualnych predyspozycji postaci. Wykorzystywanie określonych run może przynosić postaci dodatkowe korzyści, a niektóre z nich można wykorzystywać nieograniczoną liczbę razy w czasie walki.