Po badaniu może również występować ból gardła.
Panendoskopia umożliwia obejrzenie w czasie jednego badania kilku części przewodu pokarmowego: przełyku (ezofagoskopia) żołądka (gastroskopia) dwunastnicy (duodenoskopia).
W czasie badania niekiedy pobierany jest materiał do badań cytologicznych i histopatologicznych, a także wykonywane są zabiegi, takie jak polipektomia (usunięcie polipów błony śluzowej), zatamowanie krwawienia czy usunięcie ciała obcego. Zabiegi te nie są bolesne.
Zastosowanie Panendoskopia jest procedurą zarówno diagnostyczną, jak i leczniczą.
thumb|240px|Wrzody części odźwiernikowej żołądka Niektóre ze schorzeń, których wykrywanie stało się możliwe dzięki zastosowaniu panendoskopii: przełyk Barretta rak przełyku żylaki przełyku zapalenie błony śluzowej przełyku choroba wrzodowa żołądka i dwunastnicy rak żołądka, właściwie wykonywane badania przesiewowe potrafią wykryć tę chorobę we wczesnym stadium rozwoju inne złośliwe lub potencjalnie złośliwe nowotwory żołądka (np. chłoniak, GIST) zapalenie błony śluzowej żołądka, także wywoływane przez Helicobacter pylori