Po wojnie Price został 25 listopada zwolniony ze służby i wrócił do Missouri. Zakupił szmat ziemi i jako właściciel niewolników zajął się uprawą tytoniu. Jako postać bardzo popularna łatwo wybrał wybory na gubernatora stanu i sprawował ten urząd w latach 1853-1857. Jako gubernator wykazał się sprawnością i energią przy rozbudowie sieci kolejowej w swym stanie. Po wygaśnięciu mandatu był do roku 1861 komisarzem Banku Stanowego. 28 lutego tegoż roku został wybrany przewodniczącym Konferencji Stanu Missouri, która głosowała przeciw secesji.
Udział w wojnie secesyjnej Price początkowo był przeciwny secesji Missouri, ale gdy Francis Blair i gen. Nathaniel Lyon zajęli należący do milicji stanowej Camp Jackson w Saint Louis, Price zmienił przekonania. W maju 1861 roku został mianowany przez gubernatora Jacksona dowódcą nowo utworzonej Gwardii Stanowej Missouri. Prowadził swych młodych rekrutów (którzy przezywali go pieszczotliwie „Papciem”) w kampanii, która miała zapewnić przynależność Missouri do Konfederacji. Jedną z najważniejszych bitew tej kampanii była I bitwa pod Lexington, podczas której Price pokonał siły Unii płk.