Czekanowska była członkiem wielu polskich i międzynarodowych towarzystw naukowych, w latach 1975–1985 była członkiem zarządu International Council for Traditional Music. Wykładała m.in. w Konserwarium im. Czajkowskiego w Moskwie (1962), University of State Washington (1963, 1980-83), Johannes Gutenberg Universität (Mainz, 1983-84), Pittsburg University, Duquesne University, Durham University (1994). W latach 1999–2004 prowadziła wykłady oraz pełniła funkcję Kierownika Katedry Etnomuzykologii na Katolickim Uniwersytecie Lubelskim. Od 2004 wykładała w Collegium Civitas w Warszawie.
Odznaczona Krzyżem Kawalerskim Orderu Odrodzenia Polski.
Działalność naukowa Od początku swej działalności naukowo-badawczej Czekanowska specjalizowała się w etnomuzykologii. Już w latach 50. brała udział w badaniach terenowych organizowanych przez Mariana i Jadwigę Sobieskich. Jej praca magisterska dotyczyła analizy pieśni z regionu Opoczna, a rozprawa doktorska - pieśni biłgorajskich. W swojej rozprawie habilitacyjnej skoncentrowała się głównie na problematyce metodologicznej: jest twórczynią statystyczno-matematycznej metody analizy melodii ludowych.