26 stycznia 1918 Ludwig Edinger zmarł na zawał serca po udanej operacji gruczołu krokowego. Wspomnienia pośmiertne napisali Wallenberg, Kurt Goldstein, Ernst GöppertGöppert E. Ludwig Edinger † Februar 1918. Anatomischer Anzeiger 52, ss. 219-223 (1919) i Hermann OppenheimOppenheim, H. Dem Andenken an Ludwig Edinger. Deutsche Medizinische Wochenschrift 11 (1918) Georg DreyfusDreyfus GL. Ludwig Edinger†. Münchener medizinische Wochenschrift 65, ss. 272-275 (1918) i Ludwik Eliasz BregmanBregman L. Ludwik Edinger (Wspomnienie pośmiertne). Medycyna i Kronika Lekarska 53, 28, ss. 186-187 (1919). Pochowany jest na Hauptfriedhof Frankfurt, razem z żoną i córką Tilly (kwatera II, grób 21). Friedrich Edinger zginął w obozie koncentracyjnym.
Zgodnie z wolą uczonego, jego mózgowie przekazano na badania naukowe. Opis mózgu Edingera przedstawili Walther Riese i Goldstein w 1950.
Przed II wojną światową we Frankfurcie nazwano jego imieniem ulicę (Edingerstrasse);