Sekretarze generalni PAU Kolejnymi sekretarzami generalnymi PAU byli: Józef Szujski (1872–1883) Stanisław Tarnowski (1883–1890) Stanisław Smolka (1890–1903) Bolesław Ulanowski (1903–1919) Kazimierz Kostanecki (1919–1921) Stanisław Wróblewski (1921–1926) Stanisław Kutrzeba (1926–1939) Tadeusz Kowalski (1939–1948) Jan Konstanty Dąbrowski (1948–1957) Adam Vetulani (1957–1958) Józef Skąpski (1989–1994) Jerzy Wyrozumski (1994–2015) Szczepan Biliński (2015– )
Członkowie honorowi PAU Członkami honorowymi PAU byli: św. Jan Paweł II Jan Nowak-Jeziorański kardynał Franciszek Macharski Władysław Bartoszewski Tadeusz Mazowiecki Członkiem honorowym PAU jest ponadto Adam BonieckiPAUza Akademicka, Tygodnik Polskiej Akademii Umiejętności Nr 599, 28 kwietnia 2022.
Struktura PAU Biuro PAU Współcześnie PAU obejmuje wydziały:
Wydział I Filologiczny Komisja Filologii Klasycznej PAU Komisja Historii Sztuki PAU Komisja Neofilologiczna PAU Komisja Kultury Słowian PAU
Wydział II Historyczno-Filozoficzny Komisja Środkowoeuropejska PAU Komisja Wschodnioeuropejska PAU Komisja Prehistorii Karpat PAU Komisja Historii i Kultury Żydów PAU Komisja Prawnicza PAU Komisja Historii Wojen i Wojskowości PAU Komisja Nauk Ekonomicznych PAU Komisja Etnograficzna PAU Komisja Medioznawcza