Zakazał głoszenia kazań pod karą ekskomuniki i nakazał udać się tam, gdzie rozkaże. Trzy tygodnie później Girolamo odpowiedział na list, deklarując podporządkowanie się woli papieża. Mimo zakazu, miał duże grono zwolenników, zwłaszcza wśród kobiet. Pod wpływem jego nauk, wprowadzały w domach posty, przez które Signoria musiała obniżyć podatki rzeźnikom w obawie przed bankructwem. Pod koniec 1495 roku Signoria zaczęła zabiegać o uchylenie zakazu głoszenia kazań. Aleksander VI udzielił zgody, pod warunkiem ograniczenia radykalizmu dominikanina w krytyce Kurii Rzymskiej i Girolamo 17 lutego 1496 roku wystąpił publicznie. Podczas homilii obiecał posłuszeństwo Rzymowi, jednak zaznaczył, że papież jest nieomylny jedynie w sprawach wiary. Tydzień później ponownie zaatakował Kurię, zarzucając rozpustę i upadek obyczajów. W Niedzielę Palmową 1496 roku ogłosił Jezusa królem Florencji.