Członkowie PTN W działalności oddziałów i sekcji PTN bierze udział ok. 1100 członków zwyczajnych, członkowie honorowi (27 polskich i 48 zagranicznych członków honorowych [dane na rok 2018]) oraz członkowie wspierający. Członkiem zwyczajnym Towarzystwa może być lekarz lub pracownik naukowy innej specjalności specjalizujący się w dziedzinie nefrologii. Członkowie zwyczajni posiadają czynne i bierne prawo wyborcze.
Członkostwo honorowe PTN nadaje na wniosek Zarządu Głównego Walne Zgromadzenie osobom szczególnie zasłużonym dla nefrologii lub Towarzystwa. Towarzystwo ma prawo nadawać tytuł „Zasłużony dla polskiej nefrologii”. Tytuł ten może być nadany przez Zarząd Główny na Wniosek Zarządu Oddziału PTN.
Klub Młodych Nefrologów Klub Młodych Nefrologów (KMN) Polskiego Towarzystwa Nefrologicznego (PTN) powstał w 2014 roku. Celem KMN jest zacieśnianie współpracy z ERA-EDTA Young Nephrologists’ Platform oraz dbanie o jakość kształcenia podyplomowego w dziedzinie nefrologii.
Struktura organizacyjna Najwyższą władzą Towarzystwa jest Walne Zgromadzenie Członków Towarzystwa zwoływane przez Zarząd Główny z inicjatywy własnej nie rzadziej niż raz na trzy lata.
W skład Zarządu Głównego wchodzą: