Po jego odejściu, w marcu 2009, tymczasowo poprowadził zespół w trzech spotkaniach, odnosząc w nich zwycięstwo i dwa remisy, po czym ustąpił ze stanowiska na rzecz Francisco Ramíreza.
W połowie 2009 roku Arellano objął występujący w drugiej lidze Club Necaxa z siedzibą w mieście Aguascalientes. Dwa razy z rzędu – w fazach Apertura 2009 i Bicentenario 2010 – zwyciężył z nim w rozgrywkach Liga de Ascenso, co zaowocowało awansem do najwyższej klasy rozgrywkowej na koniec sezonu 2009/2010. Ze stanowiska odszedł pod koniec sierpnia 2010, po sześciu kolejkach pierwszej ligi. Na początku 2011 roku został szkoleniowcem drugoligowego Tiburones Rojos de Veracruz, który prowadził przez następne sześć miesięcy bez większych sukcesów, po czym podpisał umowę z CD Irapuato, także z drugiej ligi meksykańskiej, gdzie także pozostawał przez pół roku. We wrześniu 2012 został włączony do sztabu szkoleniowego ekwadorskiego trenera Álexa Aguinagi w drużynie San Luis FC.