Osiągnięcia naukowe Profesor Kowal opublikował łącznie prawie 300 prac naukowych, (w tym ponad 30 za granicą, oraz 4 monografie, 6 skryptów dla studentów i 3 podręczniki) dotyczących zagadnień z zakresu procesów oczyszczania wód, czynników hamujących usuwanie żelaza i manganu z wód podziemnych, wpływów zjawisk biologicznych i fizyczno-chemicznych w procesie infiltracji na jakość wody, przyczyn pogarszania się jakości wód podziemnych, procesów oczyszczania wód in situ w warstwie wodonośnej, oraz na temat wykorzystania procesu adsorpcji do oczyszczania wód. Jego podręcznik akademicki „Technologia wody”, wydany w 1977 r., był pierwszym w kraju źródłem wiedzy z tego zakresu. Podręcznik jego współautorstwa „Oczyszczanie wody – podstawy teoretyczne i technologiczne, procesy i urządzenia”, doczekał się kilku wydań. Pod jego redakcją powstał pionierski podręcznik pt. „Odnowa wody”, wydany przez Oficynę Wydawniczą Politechniki Wrocławskiej. Profesor Kowal stworzył wrocławską szkołę naukową, znaną w kraju pod nazwą „Oczyszczanie i Odnowa Wody”. Był wychowawcą wielu pokoleń inżynierów, wypromował około 200 absolwentów Politechniki Wrocławskiej. Był promotorem 23 rozpraw doktorskich. Profesor Kowal był inicjatorem utworzenia w 1979 r.