Działalność w Stowarzyszeniu Bibliotekarzy Polskich i innych organizacjach Równolegle z pracą zawodową Janina Cygańska była bardzo zaangażowana w pracę społeczną. W latach 1949–1951 działała w Dzielnicowym Ośrodku Metodycznym Pracy Pozaszkolnej na Żoliborzu oraz w Związku Nauczycielstwa Polskiego. Od 1947 r. działała w Związku Bibliotekarzy i Archiwistów Polskich, przemianowanym w grudniu 1953 r. na Stowarzyszenie Bibliotekarzy Polskich. Pełniła w stowarzyszeniu szereg funkcji, początkowo na szczeblu regionalnym (w Kole i Okręgu Warszawskim), następnie centralnym; m.in. dwukrotnie była sekretarzem generalnym Zarządu Głównego SBP (w latach 1963–1966 oraz 1972–1976), I wiceprzewodniczącą Stowarzyszenia Bibliotekarzy Polskich w latach 1976–1981, przewodniczącą Komisji Odznaczeń i Wyróżnień SBP w latach 1981–1985, a w kolejnych kadencjach wiceprzewodniczącą tej komisji. Od 1985 r. była członkiem Głównego Sądu Koleżeńskiego, a od 1997 r. do 2003 r. pełniła funkcję przewodniczącej tego sądu.