Stanowisko dyrektora szpitala w Sanoku pełnił w kolejnych latach (jego sekundariuszem był dr Salomon Ramer)•••••••••••••. Równolegle prowadził prywatną praktykę lekarską w Sanoku•••••••••••. Działał w sekcji Towarzystwa Lekarzy Galicyjskich w Sanoku, w 1903 wybrany jej przewodniczącym; w 1905 nowym prezesem wybrano Jacka Jabłońskiego, a po jego śmierci (1912) na początku 1913 dr Pajączkowskiego ponownie wybrano prezesem sekcji. W lipcu 1903 uczestniczył w XIII Zjeździe Chirurgów Polskich w Krakowie. W sierpniu 1903 wstąpił do Towarzystwa Samopomocy Lekarzy. W 1913 prowadził szkolenie sanitarne, zorganizowany przez „Samarytanina Sokolego” przy sanockim gnieździe Polskiego Towarzystwa Gimnastycznego „Sokół”Alojzy Zielecki, Rozwój ruchu niepodległościowego, W epoce autonomii galicyjskiej, w: Sanok. Dzieje miasta, Praca zbiorowa pod redakcją Feliksa Kiryka, Kraków 1995. s. 478..