Linia obsługuje również pociągi piaskowe na most zsypowy piasku budowlanego Wojciech oraz na punkt sprzedaży piasku w Pyskowicach. Na Magistrali odbywają się też jazdy testowe lokomotyw remontowanych w MTL Asco Rail w Pyskowicach, na odcinku Pyskowice – Drama oraz Pyskowice – Michał. Od 2012 roku sporadycznie po szlaku magistrali na odcinku Kotlarnia – Biskupice poruszają się składy piaskowe w związku z wygraną przez PKP Cargo Service obsługą mostu podsadzkowego Witczak KWK Bobrek Centrum, z przerwą w latach 2014-2015. Od 2001 roku stan techniczny torowisk oraz urządzeń starowania ruchem na magistrali systematycznie się pogarsza o czym świadczą stałe kontrole UTK. 4 kwietnia 2014 UTK interweniowało z powodu długotrwałego stosowania Sz na stacjach Drama i Pyskowice na linii 301, natomiast 1 października 2014 odbyła się kontrola stanu technicznego torowisk na linii, podczas której wykryto szereg nieprawidłowości. 17 marca 2015 odbyła się kontrola linii 302, podczas której stwierdzono m.in. niewłaściwe utrzymanie torowisk