Do XIII wieku Bagdad był najważniejszym miastem w świecie muzułmańskim.
thumb|upright|left|Armia Hulagu-chana pod Bagdadem Miasto zostało zniszczone przez imperium mongolskie (13 lutego 1258, następnie w 1392). Podczas ataku w 1258 roku wojska Hulagu-chana zamordowały do stu tysięcy mieszkańców. Przy życiu pozostała wyłącznie ludność chrześcijańska. Ocalenie chrześcijan wiązało się z tym, iż żona Hulagu-chana była również chrześcijanką. Najazd z 1258 roku zapoczątkował okres upadku, trwający do początku XIX wieku. Najważniejszym miastem w świecie muzułmańskim stał się Kair. Poza krótkim okresem panowania irańskiego ok. 1508 roku miasto znajdowało się w granicach Imperium Osmańskiego.
W II połowie XIX wieku Bagdad został stolicą prowincji. Pod koniec XIX wieku Bagdad rozwijał się gospodarczego. Wpływ na poprawę sytuacji ekonomicznej miał rozwój handlu z państwami europejskimi oraz budowa . W 1917 roku podczas I wojny światowej miasto zajęła Wielka Brytania. W 1921 roku Bagdad został stolicą Iraku (najpierw mandatowego Królestwa Iraku, od 1932 roku niepodległego państwa). We wrześniu 1960 roku w Bagdadzie utworzono OPEC. W latach 70. XX wieku podczas okresu boomu naftowego przeprowadzono modernizację miasta.