3. sezon Chuck doprowadza do przesłuchania Jimmy'ego przed komisją dyscyplinarną, co prowadzi do zawieszenia jego licencji i przy okazji do ujawnienia, że nadwrażliwość elektromagnetyczna Chucka nie jest prawdziwa. Howard zachęca Chucka, by ten przeszedł na emeryturę. Chuck w odwecie pozywa HHM. Howard wyrzuca Chucka z kancelarii, co doprowadza go do popełnienia samobójstwa.
Przed zabiciem Hectora Mike'a powstrzymuje Gus. Mike przeprowadza ataki na ciężarówki Hectora i kradnie 250 000 dolarów z jednej z nich. Prosi Gusa o pomoc w praniu pieniędzy. Ten fikcyjnie zatrudnia Mike'a jako eksperta ds. bezpieczeństwa w firmie Madrigal i opłaca rachunki za konsultacje. Hector planuje przejąć punkt usługowy ojca Nacho. Nacho nie chce do tego dopuścić i próbuje zabić Hectora zamieniając zażywane przez niego leki na placebo. Hector dostaje udaru, ale dzięki pomocy Gusa przeżywa, lecz pozostaje w śpiączce.