Organizacja Na czele trybunału stał inkwizytor z lombardzkiej prowincji zakonu dominikanów, który tytułowany był oficjalnie jako inkwizytor generalny Romanii i rezydował w konwencie S. Andrea w Faenzy. Podlegały mu diecezje Faenzy, Forlì, Ceseny, Rawenny, Imoli, Cervii, Bertinoro i Sarsiny. W stolicy każdej z tych diecezji inkwizytor zastępowany był przez wikariusza generalnego, nadto podlegało mu dwudziestu wikariuszy rejonowych, którym podlegały następujące wikariaty rejonowe: Brisighella, Castelbolognese, Solarolo, Fognano (utworzone w 1600), Tossignano, Riolo, Lugo, Russi, Bagnacavollo, Cotignola, Sant'Agata, Fusignano, Porto Cesenatico, Marradi i Modigliana (utworzone w 1601), Mordano, Bagnara, Casola, Meldola i Pozzolo (utworzone w 1607).
Archiwum Główne archiwum trybunału w Faenzy zostało niemal całkowicie zniszczone, oprócz części dokumentów o charakterze administracyjnym. Do czasów współczesnych zachowało się jednak archiwum wikariatu generalnego w diecezji Imoli, dokumentujące 986 procesów z lat 1551–1771, oraz niewielka część archiwum wikariatu w diecezji Forlì, zawierająca osiem fascykułów z dokumentacją procesową (w tym jeden z 1566/67 i siedem z XVII wieku).