Flora thumb|left|200px|Roślinność parku. Widoczne arekowce Na obszarze parku stwierdzono 163 gatunki roślin endemiczne dla Brazylii, z czego 94 występują w wyższych partiach górskich. Występuje tu np. peperomie (Peperomia) – Peperomia alata, Peperomia arifolia, Peperomia augescens, Peperomia blanda, Peperomia trineura oraz inne – łącznie 31 gatunków z tego rodzaju. Z rodziny pieprzowatych występują tu również przedstawiciele Manekia – Manekia obtusa i Piper – 28 gatunków, np. Piper cubataonum i Piper abutiloides. Z roślin niedrzewiastych wymienić można np. Paepalanthus gleasonii (niedotrawowate) i tabebuje, nazywane potocznie Ipês. Występują także arekowce, jak euterpy (Euterpe) i inne drzewa, jak cypry, Caesalpinia ferrea (znane jako „pau-ferro”) i Myrocarpus frondosus („cabreúva”). Miejscami rośnie araukaria brazylijska (Araucaria angustifolia), w większości jednak została wycięta. Z rodziny bromeliowatych występuje m.in. endemiczny przedstawiciel Fernseca oraz endemit z rodziny zaczerwniowatych – Itatiaia cleistopetala. Na płaskowyżu Itatiaia Plateau przeważają trawy, np.