W 1943 jego ciało zostało zidentyfikowane w toku ekshumacji prowadzonych przez Niemców pod numerem 4096, a przy zwłokach zostały odnalezione: legitymacja oficera rezerwy, książeczka wojskowa Legionów Polskich z I wojny światowej 914/18, wizytówki oraz dwie pocztówki. Figuruje na liście wywózkowej z 2 kwietnia 1940.
Jego żoną była Marią, z którą miał synów Janusza i Wiesława.
thumb|Tablica w rymanowskiej kościele parafialnym
Upamiętnienie 5 października 2007 roku Minister Obrony Narodowej Aleksander Szczygło awansował go pośmiertnie do stopnia majoraDecyzja Nr 439/MON Ministra Obrony Narodowej z dnia 5 października 2007 roku w sprawie mianowania oficerów Wojska Polskiego zamordowanych w Katyniu, Charkowie i Twerze na kolejne stopnie oficerskie. Decyzja nie została ogłoszona w Dzienniku Urzędowym MON.. Awans został ogłoszony 9 listopada 2007 roku w Warszawie, w trakcie uroczystości „Katyń Pamiętamy – Uczcijmy Pamięć Bohaterów”.
14 kwietnia 2012, w ramach akcji „Katyń... pamiętamy” / „Katyń... Ocalić od zapomnienia”, przy cmentarzu rzymskokatolickm parafii św. Wawrzyńca w rodzinnym Rymanowie został zasadzony Dąb Pamięci honorujący Jana Dankiewicza.
Dr Jan Dankiewicz został wymieniony na tablicy upamiętniającej rymanowskie ofiary II wojny światowej, ustanowionej w połowie lat 70. w kościele św.