W związku z reorganizacją oddziałów WOP, 24 kwietnia 1948 28 strażnica OP Polanowice kategorii IV została włączona w struktury 32 batalionu Ochrony Pogranicza, a 1 stycznia 1951 92 batalionu WOP w Gubinie.
Od 15 marca 1954 wprowadzono nową numerację strażnic. Strażnica WOP Polanowice III kategorii otrzymała numer 36 w skali kraju. W 1956 rozpoczęto numerowanie strażnic na poziomie brygady. Strażnica WOP Polanowice II kategorii miała nr 9 w 9 Brygadzie Wojsk Ochrony Pogranicza.
1 stycznia 1961 funkcjonowała jako 13 strażnica WOP III kategorii Polanowice w strukturach 92 batalionu WOP, a 1 stycznia 1964 jako 12 strażnica WOP Polanowice lądowa III kategorii. Natomiast w marcu 1968 jako strażnica techniczna WOP nr 11 Polanowice kategorii I.
W 1976 Wojska Ochrony Pogranicza przeszły na dwuszczeblowy system zarządzania. Strażnicę podporządkowano bezpośrednio pod sztab Lubuskiej Brygady WOP w Krośnie Odrzańskim, a w 1984 w struktury nowo utworzonego batalionu granicznego Lubuskiej Brygady WOP w Gubinie pod nazwą Strażnica WOP Polanowice lądowa.