Uważa, że należy poszukiwać płaszczyzn czynienia pokoju i budowania właściwej atmosfery w kontaktach z ludźmi o innych poglądach. Cechuje go jednak wielka ostrożność do ekumenizmu, choć nie wyklucza współpracy na niektórych odcinkach i dostrzega sens takiej współpracy.
Stosunek do lustracji thumb|Andrzej Siciński w czytelni IPN przy Pl. Krasińskich (2017) Po opublikowaniu Listy Wildsteina w polskim Kościele Adwentystów Dnia Siódmego dyskutowano nad potrzebą przeprowadzenia lustracji. Andrzej Siciński zwrócił uwagę, iż lustracja oparta na teczkach nie będzie sprawiedliwa, ponieważ teczki „rekinów donosicielstwa” zostały dawno zniszczone, a zachowały się jedynie teczki płotek. Podał też w wątpliwość wiarygodność teczek. Ocenił, że lustratorom jest bliżej do starotestamentowej etyki niż Chrystusowego nakazu miłowania nieprzyjaciół.
Kwestia wolności religijnej W swoich felietonach często podnosi tematykę wolności religijnej i krytykuje polityków za wypowiedzi, które tę wolność ignorują.