Codename: Gordon otrzymał głównie dobre recenzje krytyków gier komputerowych. Home of the Underdogs opisał ją jako „jedną z najlepszych gier fanowskich”. Gra została również doceniona dzięki włączeniu do niej pistoletu grawitacyjnego. Gameplanet uznał, że „działa on dokładnie tak, jak był reklamowany i rzeczywiście jest dość [fajny]”. Pixel Rage także opisał broń jako jedną z ważniejszych aspektów produkcji, natomiast gotoAndPlay stwierdził, że „dodaje miły akcent do gry”. Codename: Gordon chwalono również za wyjątkowo szczegółowo wykonane tła krajobrazów i unikalny styl dialogów, w których gracz posługuje się emotikonami w celu porozumiewania z innymi postaciami.
Projekt otrzymał jednak także negatywne opinie. Jedną z najważniejszych kwestii, które zostały podniesione była wydajność. GotoAndPlay zauważył, że gra ma tendencję do wyświetlania małej ilości klatek na sekundę, szczególnie podczas walki z dużą ilością przeciwników. Home of the Underdogs skarżył się także na przesadzone wymagania sprzętowe stwierdzając, że mając na uwadze prostotę gry, wymaganie procesora o częstotliwości taktowania 1.6 GHz jest zbyt wygórowane.