Z funkcji I trenera „Wojskowych” Kubicki został zwolniony przez koncern ITI 1 października 2004 roku, czyli dzień po odpadnięciu z rywalizacji o Puchar UEFA w dwumeczu z Austrią Wiedeń, późniejszym ćwierćfinalistą tamtej edycji rozgrywek. W Ekstraklasie, w momencie zwolnienia trenera, drużyna Legii miała na koncie 4 zwycięstwa, 2 remisy i 0 porażek.
W czerwcu 2005 roku Dariusz Kubicki został trenerem lokalnego rywala, warszawskiej Polonii, od listopada 2005 do 16 sierpnia 2006 był trenerem łęczyńskiego Górnika. Od 30 sierpnia 2007 do 22 lipca 2008 był trenerem gdańskiej Lechii, z którą 18 maja 2008 awansował, na dwie kolejki przed zakończeniem rozgrywek, do ekstraklasy.
4 października 2007 został zatrzymany przez Centralne Biuro Antykorupcyjne w tzw. „sprawie COS”. 22 lipca 2008 zarząd Lechii Gdańsk zawiesił Dariusza Kubickiego w prawach trenera pierwszego zespołu seniorów, ponieważ szkoleniowiec odmówił podpisania specjalnego oświadczenia antykorupcyjnego..