W 1987 roku Saporiti powrócił do Argentyny, gdzie podpisał umowę z jednym z najbardziej utytułowanych i najpopularniejszych zespołów kontynentu, Club Atlético Boca Juniors, jako kontynuator myśli szkoleniowej poprzedniego trenera, Césara Luisa Menottiego. Został zwolniony i zastąpiony przez Juana Carlosa Lorenzo po zaledwie pięciu kolejkach sezonu 1987/1988, notując bilans zwycięstwa, remisu i trzech porażek, w tym wyjazdowej przegranej 0:6 z Racing Club. Później bez większych sukcesów był opiekunem Talleres de Córdoba i stołecznego San Lorenzo de Almagro. W 1991 roku wyjechał do Meksyku, podpisując umowę z Club Necaxa z miasta Meksyk, którego szkoleniowcem pozostawał przez kolejne trzy sezony, po czym odszedł do innego zespołu z tego kraju, Club León, z którym również nie zdobył żadnego trofeum.
W 1995 roku Saporiti już po raz trzeci w karierze objął Talleres de Córdoba, gdzie spędził parę miesięcy, po czym odszedł do klubu Argentinos Juniors, który również miał okazję prowadzić kilka lat wcześniej. W lutym 1998 powrócił do Meksyku, zostając trenerem Club Celaya, który szkolił zaledwie kilka tygodni, po czym objął stołeczną ekipę Pumas UNAM.