W połowie 2005 roku opuścił Cobras na rzecz Correcaminos UAT, a później prowadził też drugoligowe rezerwy klubu Monarcas Morelia i był asystentem Enrique Lópeza Zarzy w Club Necaxa.
Wiosną 2007 Orduña po raz trzeci podpisał umowę z Correcaminos UAT, jednak jeszcze w tym samym roku został szkoleniowcem założonego zaledwie dwa lata wcześniej klubu Indios de Ciudad Juárez, także występującego w rozgrywkach drugoligowych. W jesiennej fazie Apertura 2007 wygrał z nim rozgrywki Primera División A, po pokonaniu w dwumeczu finałowym Dorados, natomiast na koniec sezonu 2007/2008 wywalczył z Indios historyczny awans do najwyższej klasy rozgrywkowej, kiedy to jego zespół zwyciężył w decydującym dwumeczu z triumfatorem rozgrywek Clausura 2008, Leónem. Swój pierwszy w historii sezon w pierwszej lidze drużyna Indios rozpoczęła jednak od czterech porażek z rzędu, przez co w sierpniu 2008 Orduña stracił pracę. Po kilku miesiącach objął posadę szkoleniowca drugoligowego Tiburones Rojos de Veracruz, a później bez większych sukcesów prowadził inne kluby z zaplecza najwyższej klasy rozgrywkowej, najpierw Lobos BUAP z Puebli, a następnie Club León.