Charakterystyczne są kończyny przednie eoabelizaura, mające budowę pośrednią między tą charakteryzującą abelizaurydy i tą spotykaną u innych ceratozaurów. Kość ramienna nie uległa redukcji i przypomina budową kości ramienne ceratozaurów nienależących do Abelisauridae; kość łokciowa i promieniowa uległy już skróceniu, ale ogólną budową bardziej przypominają kości takich ceratozaurów jak Ceratosaurus. Natomiast dłoń eoabelizaura budową przypomina dłonie późniejszych abelizaurydów: kości śródręcza są krótkie i masywne, paliczki (poza dalszymi) mają szerokość równą długości oraz słabo rozwiniętą, prawie płaską dystalną powierzchnię stawową, zaś paliczki dalsze są zredukowane.

Systematyka Z przeprowadzonej przez autorów opisu eoabelizaura analizy filogenetycznej (w oparciu o macierz danych wykorzystującą informacje z macierzy wykorzystanych w analizach Carrano i Sampsona, 2008 oraz Canale i współpracowników, 2009) wynika, że E. mefi był najbardziej bazalnym znanym przedstawicielem rodziny Abelisauridae. Wystarczy jednak wydłużenie drzewa filogenetycznego o jeden stopień w stosunku do najbardziej parsymonicznego, aby uzyskać drzewo, według którego eoabelizaur był taksonem siostrzanym do kladu obejmującego Abelisauridae i Noasauridae. Aby uzyskać drzewo, według którego E.