Był mężem historyk sztuki Teresy Małkowskiej-Holcerowej (1932-). Miał dwóch synów: Macieja, szermierza i Łukasza, konserwatora zabytków.
Bibliografia Sławomir Florjan: Wspomnienie o Zygmuncie Holcerze (1925–2004). „Wiadomości Botaniczne”. 55 (1/2), 2011. ISSN 0043-5090. Teresa Małkowska-Holcerowa, Andrzej Skowroński: Zygmunt Holcer (10.11.1925 – 17.07.2004). „Mineralogia Polonica”. 37 (1), 2006. ISSN 0032-6267.
Kategoria:Polscy mikrobiolodzy Kategoria:Polscy kolekcjonerzy Kategoria:Polscy mineralodzy Kategoria:Polscy fotografowie Kategoria:Więźniowie KL Auschwitz Kategoria:Więźniowie KL Buchenwald Kategoria:Więźniowie KL Flossenbürg Kategoria:Absolwenci Uniwersytetu Jagiellońskiego Kategoria:Odznaczeni Krzyżem Kawalerskim Orderu Odrodzenia Polski (Polska Ludowa) Kategoria:Odznaczeni Krzyżem Oficerskim Orderu Odrodzenia Polski (III Rzeczpospolita) Kategoria:Odznaczeni Krzyżem Oświęcimskim Kategoria:Pochowani na cmentarzu Rakowickim Kategoria:Urodzeni w 1925 Kategoria:Zmarli w 2004 Kategoria:Ludzie urodzeni w Krakowie