Według szacunków mikrobiom u zdrowego dorosłego człowieka może osiągać masę 2–3 kg, a na jedną komórkę ludzką może przypadać 1-10 komórek mikroorganizmów.
Znaczenie pomoc w trawieniu pokarmu, produkcja witamin, udostępnianie minerałów, rozkładanie toksyn, ochrona przed chorobami (wypieranie bądź zabijanie patogenów), wpływ na węch, pomoc w sterowaniu wzrostem organów, szkolenie komórek systemu immunologicznego, wpływ na rozwój układu nerwowego (być może także na zachowanie).
Czynniki od których zależy skład mikrobiomu Każdy człowiek ma charakterystyczny dla siebie mikrobiom. Jego skład zależy od (przykłady):
genów, miejsc pobytu, przyjmowanych leków, chorób, pożywienia, kontaktów międzyludzkich, wieku (stabilizuje się ok. 3 roku życia), części ciała (przykładowo: skóra – Propionibacterium, Corynebacterium, Staphylococcus; przewód pokarmowy – Bacteroides; pochwa – Lactobacillus, jama ustna – Streptococcus).
Mikrobiom przewodu pokarmowego
Pionierem badań nad bakteriami bytującymi w przewodzie pokarmowym był Arthur Isaac Kendall.