W związku z podejrzeniem przestępstw, 16 listopada 2008 r. odbyło się w Olsztynie referendum lokalne, w którym ponad połowa głosujących opowiedziała się za odwołaniem Czesława Małkowskiego z funkcji. Czesław Małkowski jako formalnie prezydent miasta i T. Głażewski jako pełniący obowiązki prezydenta miasta funkcje sprawowali do czasu publikacji wyników referendum w postaci Obwieszczenia Wojewody Warmińsko-Mazurskiego w Warmińsko-Mazurskim Dzienniku Urzędowym w dniu 20 listopada 2008 roku.

Tego samego dnia mandat Czesława Małkowskiego do pełnienia funkcji prezydenta miasta wygasł, a 21 listopada Prezes Rady Ministrów Donald Tusk mianował na komisarza Miasta Olsztyna Tomasza Głażewskiego, który zarządzał miastem do 9 marca 2009, czyli do dnia zaprzysiężenia nowego prezydenta.