W czasie wojny trzynastoletniej Pniewy wystawiły w 1458 roku 6 pieszych na odsiecz oblężonej polskiej załogi Zamku w MalborkuKodex dyplomatyczny Wielkiej Polski; Codex diplomaticus Majoris Poloniae zawierający bulle papieżów, nadania książąt, przywileje miast, klasztorów i wsi, wraz z innemi podobnéj treści dyplomatami, tyczącemi się historyi téj prowincyi od roku 1136 do roku 1597; zebrany z materyałow przez Kaźmierza Raczyńskiego byłego Generała W. Polskiego i Marszałka nadwornego koronnego przysposobionych; wydany przez Edwarda Raczyńskiego, Poznań 1840, s. 181.. W 1455 miał miejsce pożar miasta. Kolejny pożar wspomniano w 1501 i w 1507 kiedy z pożaru ocalała 1/6 zabudowy miejskiej. W latach 1462-1571 miasto Pniewy wymieniane zostało wśród miast wielkopolskich, ponoszących koszty utrzymania wspólnego kata, który stale przebywał w Poznaniu, a w razie potrzeby obsługiwał także inne miasta Wielkopolski.

W literaturze zawarta została niepotwierdzona informacja o zjeździe w Pniewach posłów polskich z posłami margrabiego brandenburskiego Albrechta w sprawie małżeństwa królewny Zofii Jagiellonki z Fryderykiem starszym synem Albrechta. Wydarzenie to miało odbyć się 23 kwietnia 1475.