Po wyeliminowaniu Helgi von Bulow i profesora Zempha, czołowych postaci Dywizji Paranormalnej SS bezpośrednio kierujących wykopaliskami oraz pokonaniu wskrzeszonego przez nich jednego z rycerzy księcia Henryka, Blazkowicz zostaje ewakuowany amerykańskim samolotem od 00:00 do 1:32:00..
OSA wydaje rozkaz odnalezienia i likwidacji Wilhelma „Deathshead” Strassego, wybitnego naukowca czuwającego nad projektem badawczym od strony technicznej. Jego zaawansowana technologia, wiedza oraz brak zahamowań moralnych pozwalają na produkcję nowoczesnej, bardzo skutecznej broni, takiej jak genetycznie zmodyfikowani żołnierze w pancernych zbrojach oraz broń elektromagnetyczna, która może znacznie przedłużyć wojnę lub nawet umożliwić III Rzeszy jej wygranie. Wykonując inne zadania dla OSA, takie jak zniszczenie bazy niemieckich rakiet balistycznych czy zdobycie niemieckiego superszybkiego samolotu odrzutowego, Blazkowicz trafia na trop Strassego, który prowadzi go do okupowanej Norwegii. W trakcie kulminacyjnego spotkania z uczonym dochodzi do całkowitego zniszczenia kierowanego przez niego laboratorium, jednak sam Strasse w ostatniej chwili ucieka.