Podczas misji STS-79 prom odebrał z Mira astronautkę Shannon Lucid, po jej rekordowym, 188-dniowym pobycie w kosmosie. Następnie Atlantis brał udział w budowie ISS i dostarczył wiele jej istotnych elementów.
Prom kosmiczny Atlantis wykonał 33 misje, spędził w przestrzeni 306 dni, zaliczył 4848 orbit, przeleciał łącznie 203 mln km, liczba astronautów na pokładzie: 191, liczba misji do stacji orbitalnej Mir: 7, liczba misji do ISS: 12.
+ Lp. Dzień Rok Misja Uwagi 1 3 października 1985 STS-51-J Misja Departamentu Obrony: Dowódca Karol Joseph Bobko 2 26 listopada 1985 STS-61-B Wyniesienie trzech satelitów komunikacyjnych: MORELOS-B, AUSSAT-2 i SATCOM KU-2. 3 2 grudnia 1988 STS-27 Misja Departamentu Obrony 4 4 maja 1989 STS-30 Wyniesienie satelity Magellan 5 18 października 1989 STS-34 Wyniesienie satelity Galileo 6 28 lutego 1990 STS-36 Misja Departamentu Obrony 7 15 listopada 1990 STS-38 Misja Departamentu Obrony 8 5 kwietnia 1991 STS-37 Wyniesienie Compton Gamma Ray Observatory 9 2 sierpnia 1991 STS-43 Wyniesienie TDRS-5 10 24 listopada 1991 STS-44 Misja Departamentu Obrony 11 24 marca 1992 STS-45 Pierwsza misja Atmosferycznego Laboratorium dla Zastosowań i Nauki (ang.