W 1618 roku udał się do Paryża, gdzie miał negocjować małżeństwo Krystyny Marii de France z Wiktorem Amadeuszem. Podczas tego pobytu poznał Wincentego a Paulo i Angélique Arnauld. Po powrocie do Annecy, młodszy brat Salezego Jean-François został jego biskupem koadiutorem. W 1622 roku Franciszek udał się, wraz z Karolem Emanuelem do Awinionu, aby powitać Ludwika XIII. Jego stan zdrowia bardzo się pogorszył i podczas podróży powrotnej zmuszony był zatrzymać się w Lyonie. Doznał tam apopleksji i zmarł 28 grudnia.
Dzieła Jest autorem wielu dzieł i listów o treści duchowej. Pisał w językach: francuskim, włoskim i łacinie, m.in.: Filotea. Wprowadzenie do życia pobożnego (1609) Księga kontrowersji Teotym, czyli traktat o miłości Bożej (1616).
Kult thumb|Bazylika Nawiedzenia w Annecy Beatyfikacja i kanonizacja Franciszek Salezy został beatyfikowany 8 grudnia 1661 przez papieża Aleksandra VII, który następnie kanonizował go 19 kwietnia 1665. Uznany za doktora Kościoła przez Piusa IX w 1877.
Patron W 1923, Pius XI ogłosił go patronem dziennikarzy i katolickiej prasy.
Św. Franciszek jest również patronem poetów i osób niesłyszących.