W tym samym sezonie udało się także awansować ze szczebla regionalnego do rozgrywek Pucharu Polski, gdzie jednak już w pierwszej rundzie (1/8 finału) zespół przegrał 2:7 z ówczesnym mistrzem Polski, AZS Wrocław. W kolejnym sezonie Unia zajęła drugie miejsce w tabeli grupy południowej I ligi, ale do pierwszego miejsca premiowanego barażami o awans zabrakło 13 punktów. Za to w Pucharze Polski zawodniczki dotarły aż do półfinału, choć w 1/8 i 1/4 awans uzyskały dzięki walkowerom.
Sezon 2006/2007 przyniósł awans do Ekstraligi. Zawodniczki Unii zdominowały rozgrywki w swojej grupie, wygrywając wszystkie 20 spotkań i uzyskując 26 punktów przewagi nad drugim zespołem w tabeli, a w spotkaniu barażowym rozegranym na boisku w Rudach nie dały szans Sparcie Lubliniec, wygrywając 3:0. W Pucharze swą grę raciborzanki zakończyły na ćwierćfinale.