W 2004 roku został szkoleniowcem CD Irapuato, lecz podczas przygotowań do sezonu władze ligi zdecydowały się pomniejszyć ją do osiemnastu drużyn, przez co Irapuato spadło na drugi poziom rozgrywek, a Guzmán odszedł z ekipy.
W rozgrywkach Clausura 2005, jako szkoleniowiec klubu Tecos UAG z miasta Guadalajara, zdobył pierwszy tytuł w karierze trenerskiej – wicemistrzostwo Meksyku i został wybrany najlepszym trenerem stanu Jalisco w plebiscycie radia Super Sport. Mimo sukcesów odszedł z ekipy po nieporozumieniach z zarządem i objął rywala zza miedzy, Club Atlas, z którym nie odniósł żadnego osiągnięcia. W 2006 roku został zakontraktowany przez klub Querétaro FC, lecz zrezygnował kilka dni później, również z powodu różnicy poglądów z zarządem drużyny. W tym samym roku podpisał umowę z Club Santos Laguna z miasta Torreón, którego barwy reprezentował już jako piłkarz. Pod jego przywództwem drużyna została czołową w kraju – kilka razy awansował z nią do fazy play–off, brał udział w turniejach międzynarodowych, a w sezonie Clausura 2008 wywalczył z nią pierwsze w roli trenera mistrzostwo Meksyku. Dwukrotnie był nominowany do nagrody najlepszego szkoleniowca sezonu, a w 2008 roku został honorowym obywatelem stanu Coahuila.