Zmarł 1 lipca 1974. Ciało Peróna przewieziono najpierw karawanem do katedry metropolitalnej w Buenos Aires, gdzie następnego dnia odbyła się msza żałobna. Następnie ciało, ubrane w pełny mundur wojskowy, przewieziono do Pałacu Kongresu Narodowego, gdzie wystawiono je na widok publiczny przez następne 46 godzin, podczas których przeszło obok trumny ponad 130 000 osób. W końcu, o 09:30 w deszczowy czwartek, 4 lipca, rozpoczął się kondukt pogrzebowy. Na pogrzebie Perona pojawiło się co najmniej milion osób, z których część rzucała kwiaty w trumnę i skandowała: „¡Perón! ¡Perón! ¡Perón!”, gdy ta przejeżdżała obok. Wzdłuż 16-kilometrowej (10-milowej) trasy z Pałacu do Olivos, setki uzbrojonych żołnierzy ustawionych wzdłuż niej miało za zadanie powstrzymać tłum. Ceremonię relacjonowało aż 2000 zagranicznych dziennikarzy. Kondukt pogrzebowy dotarł do celu dwie i pół godziny później. Tam trumnę powitano salwą z 21 strzałów. Wiele międzynarodowych głów państw złożyło kondolencje Argentynie po śmierci prezydenta Peróna. W związku z jego śmiercią w Argentynie ogłoszono trzydniową żałobę narodową i odwołano publiczne wydarzenia rozrywkowo-kulturalne. Żałobę narodową ogłosiło także kilka państw, większości Ameryki Południowej i Północnej m.in.