W epizodzie „Knee-Deep in the Dead” bohater walczy z demonami i opętanymi ludźmi w obiektach wojskowych i zakładach przetwarzania odpadów na Fobosie. Epizod kończy się walką z dwoma potężnymi demonami Baron of Hell, które strzegą teleportu do bazy na Deimosie. Po walce bohater przechodzi przez teleport i wpada w zasadzkę hordy przeciwników. W „The Shores of Hell” przedziera się przez opanowane przez zło ośrodki badawcze na Deimosie, a na koniec pokonuje gigantycznego cyberdemona. Z punktu widokowego odkrywa, że księżyc unosi się nad piekłem, i zjeżdża na linie na jego powierzchnię. W „Inferno” walczy w samym piekle i niszczy cybernetycznego demona-pająka, który kierował inwazją na księżyce. Gdy otwiera się portal na Ziemię, bohater przechodzi przez niego i odkrywa, że Ziemia również została najechana. W „Thy Flesh Consumed” walczy z najeźdźcami na Ziemi, co stanowi wstęp do fabuły Dooma II.