Od tej pory rebelianci oprócz osobnych ataków na siły rządowe, prowadziły intensywną rywalizację o wpływy w kraju między sobą.
23 grudnia 2010 Szebabowie przejęli kontrolę nad głównym miastem, pirackim Harardhere, które Hizbul Islam zajęli 2 maja 2010. Po tym wydarzeniu, wieczorem 23 grudnia rebelianci z Hizbul Islam zdecydowali się połączyć z ekstremistami z Al-Shabaab, wspieranych przez Al-Kaidę. Fuzja miała na celu obalenie prezydenta Ahmeda i ustanowienie islamskiego kalifatu w Somalii. Tym samym zakończył się rozłam wśród somalijskich fundamentalistów islamskich.
Wobec klęsk Szebabów na froncie pod Kismaju, 24 września 2012 Mohamed Moallin ogłosił wydzielenie się ugrupowania Hizbul Islam z Al-Shabaab. Decyzję motywował zmianami na somalijskiej scenie politycznej. Dodał, że ugrupowanie nie zgadzało się z filozofią polityczną, a bojownicy zostali zdominowani przez swojego sojusznika. Lider Hizbul Islam, Szejk Hassan Dahir Aweys, krytykował islamistów z Al-Shabaab za zabijanie cywilów i powiązania z Al-Kaidą.