Wojny nie przeżył Marc Bloch (rozstrzelany przez Gestapo w 1944), Febvre stał się tym samym głównym kontynuatorem "Annales" w okresie powojennym, później zastąpił go uczeń, Fernand Braudel. Febvre podjął się dzieła dokończenia i publikacji książki Blocha pt. Apologie pour l'histoire ou Métier d'historien (1949) (polski tytuł: Pochwała historii, czyli o zawodzie historyka). Należał do francuskiej delegacji na konferencję w Londynie formującą UNESCO. Współtworzył szóstą sekcję École Pratique des Hautes Études, otwartą w 1948. Był autorem ok. 1300 recenzji naukowych. W 1949 przeszedł na emeryturę. Otrzymał doktorat honoris causa Uniwersytetu Brukselskiego. W latach 90. wydano drukiem jego obszerną korespondencję z Markiem Blochem, tyczącą się głównie spraw związanych z „Annales”.

Wybrane publikacje Philippe II et la Franche-Comté. Étude d'histoire politique, religieuse et sociale, Paris, Honoré Champion, 1911, 808 p. Réédité aux Éditions Perrin, Paris, 2009, 816 p. (avec une préface d'Emmanuel Le Roy Ladurie). Notes et documents sur la Réforme et l'Inquisition en Franche-Comté, Paris, 1911, 336 p. Histoire de la Franche-Comté, Paris, Boivin, 1912, 260 p. La Terre et l'évolution humaine, Paris, Albin Michel, « L'évolution de l'Humanité », 1922. Un Destin.