Potwierdzenie przez dalsze badania pokrewieństw wskazanych na powyższym drzewie filogenetycznym oznaczałoby, że mozazaury w tradycyjnym rozumieniu są taksonem polifiletycznym. Konieczne stałoby się przedefiniowanie Mosasauridae i włączenie do tej grupy części taksonów, które ze względu na budowę kończyn dawniej byłyby zaliczone do aigialozaurów (rozwiązanie preferowane przez autorów opisu Dallasaurus), lub też przeciwnie – wyłączenie z Mosasauridae wszystkich taksonów poza rodzajem Mosasaurus i jego najbliższymi krewnymi mającymi kończyny przekształcone w wiosłowate płetwy (rozwiązanie preferowane przez Caldwella, 2012).

Klasyfikacja thumb|150px|Taniwhasaurus thumb|150px|Platecarpus thumb|150px|Clidastes thumb|150px|Prognathodon

Podrodzina Tylosaurinae Hainosaurus Tylosaurus Taniwhasaurus Lakumasaurus Podrodzina Plioplatecarpinae Platecarpus Angolasaurus Ectenosaurus Selmasaurus Igdamanosaurus Yaguarasaurus Plioplatecarpus Podrodzina Mosasaurinae Dallasaurus Clidastes Mosasaurus Moanasaurus Amphekepubis Plotosaurus Globidens Prognathodon Plesiotylosaurus Carinodens