W 1975 Hatoyama poślubił, poznaną w czasie studiów, Miyuki. Ma z nią jednego syna, Kichirōr, inżyniera mieszkającego w Rosji. Jego żona, była aktorka, znana jest z licznych występów i kontrowersyjnych wypowiedzi telewizyjnych na tematy duchowe. W jednym z nich stwierdziła, że odwiedziła planetę Wenus w czasie podróży pozaziemskiej na pokładzie UFO, w innym, że w dawnym wcieleniu spotkała aktora Toma Cruise’a. Yukio Hatoyama został obdarzony przez partyjnych kolegów przydomkiem „Obcy”, odnoszącym się do jego wyglądu i mało ekspresyjnego charakteru.
Kariera polityczna W latach 1983–1986 Hatoyama pełnił funkcję prywatnego sekretarza swego ojca Iichirō Hatoyamy, który był w tym czasie deputowanym w parlamencie. W 1986 sam został wybrany do Izby Reprezentantów w 9. okręgu Hokkaido z ramienia Partii Liberalno-Demokratycznej (PLD), z której później wystąpił. W wyborach w 1990, 1993, 1996, 2000, 2003, 2005 i w 2007 ponownie uzyskiwał reelekcję w parlamencie.