Praca zawodowa W latach 1995–1997 nauczyciel w IX LO im. Klementyny Hoffmanowej w Warszawie, a następnie etatowy dziennikarz redakcji „Życie Warszawy” (1997–1999). Redagował kolumnę historyczną Warszawa Wspomnień. Współpracownik varsavianisty red. Jerzego Kasprzyckiego. W 1999 r. podjął pracę w Wydziale Kultury Urzędu Miasta w Legionowie. Twórca i kierownik Zbiorów Historycznych Miasta Legionowo (od 2001 r.), a następnie dyrektor Muzeum Historycznego w Legionowie (2006-2025).
Muzeum pod kierownictwem J. Szczepańskiego trzykrotnie zdobyło I nagrodę w konkursie Mazowieckie Zdarzenia Muzealne „Wierzba” za wystawy: W krainie lodów i książek – rzecz o Alinie i Czesławie Centkiewiczach (2013); Przemysłowe Legionowo 1897–1939 (2014) oraz Nad głowami sosny szumiące... 100 rocznica nadania nazwy Legionowo (2020 r.). W 2015 r. Generalny Konserwator Zabytków nadał odrestaurowanemu budynkowi Muzeum Historycznego – Filii „Piaski" prestiżowe wyróżnienie w Konkursie „Zabytek Zadbany”.
Działalność społeczna i samorządowa Od 1994 r. członek Towarzystwa Przyjaciół Legionowa, wielokrotny wiceprezes i prezes TPL. W 2002 r. współzałożyciel z prof. Arkadiuszem Kołodziejczykiem czasopisma historycznego pt. „Rocznik Legionowski”.