Od roku 1934 pracował w Gdyni w przedsiębiorstwie „Żegluga Polska”. W październiku 1939 r. został zmuszony przez Niemców do natychmiastowego opuszczenia swojego mieszkania w Gdyni i wysiedlony do Łowicza w Generalnym Gubernatorstwie. W tym też czasie Niemcy zniszczyli w drukarni cały nakład książki autorstwa Franciszka Łypa pt. Afryka – rozwój kontynentu pod wpływem Europejczyków, stanowiącej monografię ekonomiczno-gospodarczą.
Od 1945 r. mieszkał na Śląsku, będąc pozbawiony przez reżim PRL możliwości kontaktów z zagranicą. Przechodząc na emeryturę w 1960 r. osiadł w Brwinowie k. Warszawy, gdzie zmarł 24 września 1971 r.
Publikacje O immunizowaniu zboża, Kurytyba 1923. Ekspedycja do Angoli, „Morze” 1929, nr 4–5, s. 34–36. Wysoki płaskowyż Angoli : sprawozdanie kierownika ekspedycji polskiej do Angoli w roku 1929, Warszawa 1930. Wiadomości o wysokim płaskowyżu Angoli, Warszawa 1931. Projekt osadnictwa żydowskiego w Angoli, „Morze” 1934 nr 2, s. 23. Republika Murzyńska – Liberja (krótki zarys monograficzny), „Sprawy Morskie i Kolonialne”, 1935, z. 2, s.