Gdy dotarł na Mustafar, ukryty na statku byłej królowej Naboo, Anakin był zaskoczony. W gniewie zaczął dusić swoją żonę Mocą, myśląc, że to ona sprowadziła mistrza Jedi. Po chwili rozpoczął się długi pojedynek na miecze świetlne. Skywalker przegrał go – Kenobi odciął mu obie nogi i lewą rękę. Gdy odchodził, powiedział mu, że kochał go jak brata i że zawiódł wszystkich – miał przywrócić równowagę Mocy, a nie pogrążyć ją w ciemności. Nie zdecydował się jednak dobić swojego byłego ucznia. Zabrał z planety nieprzytomną Amidalę i udał się na asteroidę Polis Massa. Tam kobieta urodziła bliźnięta – Luke’a i Leię – po czym zmarła. Wspólnie z Yodą i Bailem zdecydował, że należy ukryć gdzieś dzieci Vadera. W końcu Kenobi postanowił, że uda się na Tatooine, gdzie przekaże Luke’a jego ciotce i wujowi, a sam osiedli się na uboczu i będzie mieć na niego oko.
Czasy Imperium i śmierć mały|upright|Alec Guinness, pierwszy odtwórca roli Obi-Wana Dziewiętnaście lat później (0 BBY – Nowa nadzieja) stary już Kenobi wkroczył do akcji. W wyniku splotu nieoczekiwanych wydarzeń spotkał się z Lukiem, a następnie nakłonił go do opuszczenia ojczystej planety i (niedoszłego) lotu na Alderaan.