Postanowił zawiązać współpracę z Karl-Heinzem Strouxem, pracującym w teatrze w Düsseldorfie, z którym od tej pory Kipphardt zobowiązany był umową autorską. W Düsseldorfie wniósł Kipphardt wniosek o pozwolenie na wyjazd z NRD, którego mu odmówiono. Po tym wszystkim Kipphardt został wykluczony z SED.
Poprzez wpływy z umów autorskich Kipphardt miał czas, żeby napisać sztukę Pies generała. Znalazł wydawnictwo dla swoich publikacji. W 1961 r. rodzina wyprowadziła się do Monachium. Kipphardt poznał w 1962 r. Pię Marie Pavel. Ona także miała rodzinę i dwoje dzieci. Oboje rozwiedli się i do śmierci pisarza mieszkali razem. Ich wspólne dzieci – Franz i Moritz przyszły na świat w 1966 i 1969 r. Pia Pavel brała udział w pracy Kipphardta – poszukiwała materiałów, redagowała i brała na siebie zadania lektorskie.
Za sprawą sztuki W sprawie J. Roberta Oppenheimera Kipphardt osiągnął znaczny sukces w obu częściach Niemiec. Zdobył liczne nagrody, m.in. Nagrodę im. Gerharta Hauptmanna (1964) oraz Nagrodę im. Adolfa Grimme.