zł, jest Maciej Jagodziński-Jagennmerr.

Kierownictwo Dyrektorzy: Paweł Machcewicz (od 28 listopada 2008 do 6 kwietnia 2017) Karol Nawrocki (od 19 października 2017 do 23 lipca 2021; od 6 kwietnia 2017 jako p.o.) Grzegorz Berendt (od 21 lipca 2022 do 31 marca 2024; od 23 lipca 2021 jako p.o.) Rafał Wnuk (od 1 kwietnia 2025; od 1 kwietnia 2024 jako p.o.)

Wicedyrektorzy / zastępcy dyrektora: Piotr M. Majewski (od 1 czerwca 2009 do 6 kwietnia 2017) Tomasz Gliniecki (od 1 czerwca 2017 do ?) Przemysław Kowalczuk (od 1 czerwca 2017 do ?) Julia Olechno (od 2017 do ?) Grzegorz Berendt (od 4 maja 2017 do 21 lipca 2022) Tomasz Szturo (od 2018 do ?) Waldemar Szulc (od 2020 do listopada 2023) Marek Szymaniak (od 1 października 2021 do 13 listopada 2023) Janusz Marszalec (od 1 grudnia 2008 do 6 kwietnia 2017 i od 2 kwietnia 2024) Ewa Lidzbarska-Kreft (od 2 kwietnia 2024) Mateusz Jasik (od 2024)

Struktura W ramach muzeum funkcjonują następujące działy: Zbiorów i Digitalizacji, Komunikacji i Promocji, Biblioteka i Mediateka, Zamówień Publicznych, Wydarzeń Kulturalnych, Personalny, Zabezpieczenia i Eksploatacji, Archeologii, Oddział Muzeum Westerplatte, Konserwacji, Wystaw, Wydawniczy, Edukacji, Naukowy, Marketingu i Sprzedaży, Inwestycji, Administracji, Kino Muzeum, Programów i Współpracy, Biuro Dyrektora.