Pierwsze zastosowanie bojowe w grudniu 1964 roku potwierdziły wysoką skuteczność tego samolotu. Po pierwszych lotach bojowych załogi tych samolotów nadały im nazwę Spooky (Upiorny). W późniejszym czasie przebudowano następne cztery C-47, jednak z braku Minigunów zabudowano od 8-10 karabinów maszynowych Browning M2 (kaliber 12,7 mm), a samoloty otrzymały oznaczenie AC-47D. Ta wersja uzbrojenia miała mniejszą szybkostrzelność i skuteczność bojową.
W grudniu 1969 roku armia amerykańska wycofała AC-47 zastępując je nowymi samolotami Lockheed AC-130, które powstały po przebudowie samolotów C-130 Hercules.
AC-47T Fantasma W 1987 roku w Kolumbii przebudowano pięć samolotów C-47 do wersji AC-47T nazwanej w języku hiszpańskim Fantasma (ang. Spooky). Oryginalnie były uzbrojone w trzy stałe karabiny maszynowe M3 kalibru 12,7 mm w oknach lewej burty, z celownikiem z samolotu T-33A w lewym oknie kokpitu. W 1994 roku trzy samoloty zmodernizowano, wyposażając w silniki turbośmigłowe Pratt & Whitney PT6A-67R ze śmigłami pięciołopatowymi. Silniki były mocniejsze, przez co zwiększono ładowność samolotu do 5 ton.